Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNTN1Q12860 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CNTN1Q12860 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNTN1Q12860 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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