Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2Q12800 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms