Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms