Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1T1Q06455 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1T1Q06455 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms