Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EGR4Q05215 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EGR4Q05215 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms