Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CD164Q04900 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CD164Q04900 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms