Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EMX2Q04743 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms