Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms