Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCNT1Q02742 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms