Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1DQ01668 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms