Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED6P86452 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms