Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX3P78415 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX3P78415 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX3P78415 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX3P78415 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX3P78415 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms