Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX6P78412 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX6P78412 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX6P78412 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX6P78412 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms