Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2IP78347 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IP78347 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms