Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms