Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CABP4P57796 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABP4P57796 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABP4P57796 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP4P57796 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP4P57796 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP4P57796 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP4P57796 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms