Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAG2P55895 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms