Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NESP48681 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NESP48681 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NESP48681 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NESP48681 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NESP48681 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NESP48681 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NESP48681 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NESP48681 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NESP48681 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NESP48681 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NESP48681 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NESP48681 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NESP48681 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NESP48681 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NESP48681 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NESP48681 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms