Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms