Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM5P33992 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM5P33992 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM5P33992 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM5P33992 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM5P33992 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms