Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF1P30408 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF1P30408 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms