Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP1P29466 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP1P29466 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP1P29466 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP1P29466 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms