Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT1P21579 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms