Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4BPBP20851 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4BPBP20851 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms