Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PVALBP20472 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PVALBP20472 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PVALBP20472 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PVALBP20472 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms