Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB4P17483 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms