Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VPREB1P12018 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms