Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD28P10747 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD28P10747 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD28P10747 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms