Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2BP0DI82 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms