Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2P0DI81 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2P0DI81 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms