Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSF1RP07333 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF1RP07333 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms