Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB2P05107 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGB2P05107 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms