Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOA1P02647 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOA1P02647 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms