Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABARAPO95166 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms