Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBOX1O75936 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBOX1O75936 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms