Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NIPSNAP2O75323 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms