Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN2BO60939 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN2BO60939 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN2BO60939 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN2BO60939 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SCN2BO60939 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms