Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BNIP3LO60238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms