Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DENRO43583 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DENRO43583 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms