Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP1O00294 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP1O00294 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP1O00294 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms