Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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