Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L21D6R901 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L21D6R901 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms