Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRDCB7Z8K6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms