Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-2B6SEH9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-2B6SEH9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms