Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL050331.2-201ENST00000457319 421 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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SCN4AP35499 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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