Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOP58Q9Y2X3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms