Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms