Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPS5Q9UPZ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS5Q9UPZ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms