Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHF8Q9UPP1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHF8Q9UPP1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms