Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNRF3Q9ULT6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms